Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNB1P35222 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms