Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPC1P35052 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPC1P35052 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms