Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms