Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH5P33151 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH5P33151 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH5P33151 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH5P33151 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH5P33151 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH5P33151 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH5P33151 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH5P33151 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH5P33151 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH5P33151 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH5P33151 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH5P33151 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH5P33151 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH5P33151 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH5P33151 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH5P33151 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH5P33151 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms