Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP1P32455 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP1P32455 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP1P32455 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP1P32455 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP1P32455 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP1P32455 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP1P32455 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP1P32455 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms