Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms