Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms