Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLIP1P30622 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms