Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND3P30281 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND3P30281 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND3P30281 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND3P30281 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND3P30281 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms