Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms