Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTSSP25774 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTSSP25774 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTSSP25774 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTSSP25774 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSSP25774 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSSP25774 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms