Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCHP24723 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms