Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM1P23921 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM1P23921 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM1P23921 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM1P23921 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM1P23921 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM1P23921 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM1P23921 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM1P23921 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRM1P23921 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRM1P23921 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms