Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPREP23469 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPREP23469 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPREP23469 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPREP23469 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPREP23469 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPREP23469 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPREP23469 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPREP23469 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPREP23469 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPREP23469 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPREP23469 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPREP23469 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPREP23469 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms