Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HRCP23327 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
HRCP23327 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
HRCP23327 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HRCP23327 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HRCP23327 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HRCP23327 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HRCP23327 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HRCP23327 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HRCP23327 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HRCP23327 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
HRCP23327 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
HRCP23327 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
HRCP23327 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
HRCP23327 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
HRCP23327 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
HRCP23327 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HRCP23327 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HRCP23327 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HRCP23327 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HRCP23327 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HRCP23327 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HRCP23327 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HRCP23327 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HRCP23327 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HRCP23327 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
HRCP23327 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HRCP23327 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HRCP23327 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HRCP23327 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HRCP23327 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HRCP23327 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
HRCP23327 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HRCP23327 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms