Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALB2P22676 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALB2P22676 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CALB2P22676 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALB2P22676 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALB2P22676 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALB2P22676 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms