Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA5P20719 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms