Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP4AP20648 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms