Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PVALBP20472 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PVALBP20472 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PVALBP20472 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PVALBP20472 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PVALBP20472 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PVALBP20472 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms