Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms