Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XBP1P17861 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XBP1P17861 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XBP1P17861 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XBP1P17861 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms