Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms