Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSP16219 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSP16219 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSP16219 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSP16219 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSP16219 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSP16219 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSP16219 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms