Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAV1P15498 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAV1P15498 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VAV1P15498 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VAV1P15498 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAV1P15498 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAV1P15498 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAV1P15498 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAV1P15498 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAV1P15498 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAV1P15498 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAV1P15498 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms