Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPBP14678 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms