Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DOBP13765 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DOBP13765 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms