Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms