Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYL4P12829 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYL4P12829 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYL4P12829 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYL4P12829 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYL4P12829 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYL4P12829 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYL4P12829 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYL4P12829 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYL4P12829 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms