Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms