Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms