Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PF4V1P10720 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms