Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI3P10071 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI3P10071 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI3P10071 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI3P10071 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI3P10071 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI3P10071 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI3P10071 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI3P10071 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI3P10071 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI3P10071 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI3P10071 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI3P10071 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GLI3P10071 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GLI3P10071 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI3P10071 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI3P10071 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI3P10071 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms