Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN3P07498 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN3P07498 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN3P07498 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms