Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDHBP07195 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDHBP07195 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDHBP07195 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LDHBP07195 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDHBP07195 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDHBP07195 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDHBP07195 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDHBP07195 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDHBP07195 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDHBP07195 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDHBP07195 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDHBP07195 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDHBP07195 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDHBP07195 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDHBP07195 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms