Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTMAP06454 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTMAP06454 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTMAP06454 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTMAP06454 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTMAP06454 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTMAP06454 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTMAP06454 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTMAP06454 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms