Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPN1P04843 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPN1P04843 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPN1P04843 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPN1P04843 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPN1P04843 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPN1P04843 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPN1P04843 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPN1P04843 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPN1P04843 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPN1P04843 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPN1P04843 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPN1P04843 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPN1P04843 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN1P04843 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN1P04843 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPN1P04843 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms