Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRM2P04554 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRM2P04554 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRM2P04554 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRM2P04554 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRM2P04554 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRM2P04554 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRM2P04554 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRM2P04554 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRM2P04554 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRM2P04554 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRM2P04554 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms