Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms