Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACSL3O95573 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACSL3O95573 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACSL3O95573 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL3O95573 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL3O95573 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL3O95573 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL3O95573 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL3O95573 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL3O95573 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSL3O95573 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms