Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms