Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB5O95377 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB5O95377 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB5O95377 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB5O95377 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB5O95377 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB5O95377 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB5O95377 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB5O95377 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB5O95377 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB5O95377 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB5O95377 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB5O95377 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB5O95377 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB5O95377 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms