Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD4O95243 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD4O95243 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD4O95243 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD4O95243 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD4O95243 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD4O95243 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD4O95243 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD4O95243 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD4O95243 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms