Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F6O75461 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F6O75461 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F6O75461 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F6O75461 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms