Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms