Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF40O75150 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF40O75150 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF40O75150 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF40O75150 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF40O75150 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF40O75150 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF40O75150 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms