Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSCO60682 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSCO60682 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSCO60682 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSCO60682 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSCO60682 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSCO60682 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms