Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORBS3O60504 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORBS3O60504 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORBS3O60504 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORBS3O60504 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORBS3O60504 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORBS3O60504 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms