Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms