Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR1O43759 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 363.1 ms