Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCP110O43303 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCP110O43303 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCP110O43303 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCP110O43303 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCP110O43303 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCP110O43303 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCP110O43303 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCP110O43303 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCP110O43303 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCP110O43303 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCP110O43303 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCP110O43303 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCP110O43303 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms